本所於民國89年8月設立，旨在培育宗教學術研究、宗教教育與宗教服務之人才。從宗教的實踐經驗與教學研究中，發展人文與社會關懷的特色。此目標為從事濟世服務多年的慈濟社群所激發，本所師生可就近參與觀察慈濟多元的濟世工作，從豐富的田野實踐中採擷教學與研究之素材。
為充分運用資源，結合理論與實務，不同於國內現有宗教系所偏於教授宗教典籍與文獻，本所鼓勵學生做田野調查，乃至於宗教對身心靈、對社會和個人苦痛皆能發揮療癒作用的探討，期望訓練研究生從知識到生命的整體領悟學習。
本所教師的研究皆以「信仰、實踐與療癒」為核心，自有其合作與互補的作用，以下幾個研究主題，是本所教師聚焦的研究重點：
1.宗教理論與經典之詮釋
2.信仰實踐與宗教療癒
3.民間信仰與民間佛教研究
4.宗教哲學與宗教倫理
5.人間佛教與慈濟人文
